ศูนย์ปฏิบัติการต่อต้านการทุจริต (ศปท.) มีอำนาจหน้าที่เสนอแนะแก่ปลัดกระทรวงเกี่ยวกับการป้องกัน ปราบปรามการทุจริตและประพฤติมิชอบของส่วนราชการในสังกัด รวมทั้งประสานงาน เร่งรัด กำกับ และติดตามให้ส่วนราชการในสังกัดให้ส่วนราชการในสังกัดดำเนินการตามแผนปฏิบัติการป้องกัน ปราบปรามการทุจริตและประพฤติมิชอบของส่วนราชการ